Ressources pour construire et visualiser des modèles moléculaires en 2D et en 3D 


Les auteurs recommandent les logiciels suivants pour visualiser et construire des modèles moléculaires virtuels en 2D et en 3D.

La plupart des logiciels énumérés ci-dessous ont été conçus pour fonctionner sur PC et sont gratuits. Les logiciels iMol et PyMOL fonctionnent sur MAC.


1. Avogadro

Comment utiliser le logiciel Avogadro? Consultez le site suivant de l'Académie de Nantes (France). Très bien fait, ce document permet de vous approprier rapidement Avogadro.

www.pedagogie.ac-nantes.fr/html/peda/scphys/flash/avogadro.swf

Si cela ne fonctionne pas, essayez le site d'où la référence précédente est tirée.

Espace Pédagogique : physique chimie − logiciel Avogadro

Autres sites qui peuvent être utiles:

La chimie des molécules avec Avogadro

Utilisation d'Avogadro, boîte de modèles moléculaires virtuelle −      YouTube

Pour aller plus loin (en anglais), consultez le site suivant:

Category: Tutorials − Avogadro − Free cross-platform molecule editor

 

2. Jmol

Le logiciel Jmol permet de visualiser les molécules en 3D. Téléchargez à partir du site suivant, très utile pour la visualisation de nombreux types de fichiers et d'animations:

3. ChemSketch

Voici un outil puissant à télécharger :

Pour vous familiariser avec lui, consultez le Tutoriel ChemSketch de Serge Rodrigue et Michèle Ferron du Cégep de Montmorency:
‎www.cmontmorency.qc.ca/~jccayer/esz/Theorie_08_Logiciel_de_chimie_ChemSketch.pdf

4. PyMOL

Ce logiciel est  plus difficile à comprendre, mais son utilisation est cependant bien décrite dans les deux documents suivants. Le premier :

http://www.tice.ac-versailles.fr/logicielslibres/spip.php?article201 Pymol − Logiciels libres et enseignement.

Le second est en format pdf:

 5. iMol

Ce logiciel conçu pour le MAC est très facile à utiliser. Téléchargez-le sur le site suivant: